Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms