Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SRPRBQ9Y5M8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms