Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms