Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms