Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC5Q9UQL6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms