Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms