Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms