Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF3Q9ULT6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms