Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF608Q9ULD9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF608Q9ULD9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms