Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms