Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms