Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIKQ9UKE5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms