Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms