Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEFF2Q9UIK5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms