Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms