Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms