Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFDP1Q9UEE9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms