Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms