Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms