Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms