Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms