Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TDP1Q9NUW8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TDP1Q9NUW8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TDP1Q9NUW8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDP1Q9NUW8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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