Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms