Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms