Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms