Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPHK2Q9NRA0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK2Q9NRA0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms