Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MID1IP1Q9NPA3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms