Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms