Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A3Q9HC58 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms