Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR6Q9HBX8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms