Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00597Q9H2U6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms