Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms