Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms