Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms