Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms