Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms