Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLDIP3Q9BY77 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms