Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms