Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNS3Q9BQ31 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNS3Q9BQ31 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms