Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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