Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms