Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms