Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms