Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRIQ1Q96JM4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ1Q96JM4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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