Protein–RNA interactions for Protein: Q96JL9

ZNF333, Zinc finger protein 333, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF333Q96JL9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF333Q96JL9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms