Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms