Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTV1Q96GA3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms