Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHFRQ96EP1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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