Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms