Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms